Bendera klub bola Badai Biru Brotherhood berbentuk persegi panjang dengan dominasi warna biru dan aksen kuning mencolok. Pada bagian tengah terdapat logo klub Persma Manado dengan latar perisai ungu, bola, dan ikon pohon kelapa. Tulisan “Badai Biru”, angka tahun “1960”, serta slogan “Torang Samua Basudara” tercetak tegas dalam font besar dan jelas. Desain ini menegaskan identitas, kebersamaan, serta semangat suporter sepak bola, cocok untuk digunakan dalam stadion, acara komunitas klub, atau sebagai atribut identitas penggemar setia di wilayah Manado.